纪晓岚多次上书弹劾，和珅怀恨在心。一次，和珅家中大摆筵席，邀请纪晓岚。酒足饭饱后，和珅假笑着指着院子里的一棵枯死的树说：“纪大人，久闻您才思敏捷，今日就以这棵枯树为题，作一首诗如何？”
纪晓岚心里明白和珅是想让他出丑，但他毫不畏惧，略作思索，张口就来：“此树莫怪不成材，只因生长近楼台。世人皆赞花娇艳，却忘枯木也曾栽。”
和珅听后，脸色阴沉，皮笑肉不笑地说：“纪大人果然好才情，只是这诗里，似乎另有深意啊。”
纪晓岚笑着回应：“和大人多心了，不过是触景生情，随意吟来。”
终于，在处理盐政亏空案时，和珅暗中指使亲信篡改证据，将亏空责任嫁祸给纪晓岚。
朝堂上，纪晓岚据理力争：“陛下，这证据明显被篡改，臣是冤枉的。此案背后定有蹊跷，还望陛下明察。”
和珅却在一旁狡辩：“陛下，纪晓岚分明是在狡辩，证据确凿，他难逃罪责。”乾隆一时被蒙蔽，盛怒之下将纪晓岚贬谪至新疆乌鲁木齐。
被贬新疆，纪晓岚没有自怨自艾，而是深入了解当地风土人情，看到边疆百姓生活艰苦，他心疼不已。他找到当地官员说：“大人，此地百姓艰难，咱们得想法子改善。我知晓一些改良耕种的法子，或许可行。”
官员皱着眉说：“纪大人，不是不想做，只是这实施起来困难重重啊。”
纪晓岚拍着胸脯：“大人放心，我与您一同想办法，先从小范围试试。”
此后，纪晓岚亲自下田，指导百姓改良耕种方法，又带领大家寻找水源，兴修水利。在他的努力下，当地的粮食产量逐渐提高，百姓们对他感激不已。
几年后，乾隆念及纪晓岚的才学，将他召回京城，命他主持编纂《四库全书》。纪晓岚深知任务艰巨，却毫不犹豫接受。他去拜访戴震，诚恳地说：“东原兄，如今要编纂《四库全书》，非你相助不可，不知你可愿出山？”
戴震拱手道：“纪兄相邀，岂敢不从。只是这工程浩大，需细细谋划。”
纪晓岚点头：“正是，咱们召集各方学者，共同商讨。”于是，纪晓岚四处奔走，邀请了姚鼐、王念孙等一众知名学者，组建起编纂团队。
编纂过程中，关于宋明理学着作的收录，学者们各执一词。在学术辩论会上，一位学者激动地说：“朱熹之学乃正统，应多收录其着作。”
另一位学者反驳：“陆九渊的心学同样重要，不可偏废。”两人争得面红耳赤，互不相让。
纪晓岚赶忙起身，双手虚按，说道：“二位莫急，依我看，二者皆有可取之处，咱们应客观收录，展现学术全貌。不如这样，将两家经典着作都完整收录，再附上历代学者对其的解读与评论，如何？”众人听后，纷纷点头，一场争论就此平息。
经过十余年的艰辛努力，《四库全书》编纂完成。乾隆看着这部巨着，欣慰地对纪晓岚说：“纪昀，你功不可没啊！”
纪晓岚连忙跪地：“陛下圣明，这是众学者共同努力的结果，臣不过略尽绵薄之力。”
晚年的纪晓岚热衷于培养年轻学子，家中常常高朋满座。有学子问：“纪大人，如何才能在科举中取得好成绩？”
纪晓岚笑着说：“读书不能死记硬背，要理解其中道理，关心时事，有自己的见解。平日里多积累，考场上才能文思泉涌。”
又有学子问：“那为官之道呢？”
纪晓岚神色严肃：“为官要清正廉洁，心系百姓，切不可为一己私利，误国误民。”学子们听后，都若有所思，将纪晓岚的话铭记于心。