在光明顶被毁后，明教众人逃往坐忘峰，商议明教以后的大事，烈火旗、洪水旗、锐金旗自然要抗击蒙古，而厚土旗、巨木旗则说等找到石教主再定。衣飞扬为免纷争，于是下令由洪水旗主江海波守护坐忘峰。锐金旗主铁三山带领旗下弟子赶往四川等地与其他法王汇合，率领义军抵抗蒙古。烈火旗主秦川跟随衣飞扬前往江南组织义军反抗蒙古。巨木旗主吴世风赶往西北招兵买马，厚土旗主玛雅图要他四处寻找石教主影踪。五旗都没有意见，便分头行动。
这次在大都城发现石教主的踪迹，便是厚土旗下的弟子发现，这才通知衣飞扬等人。衣飞扬知道后便带一些烈火旗弟子到了大都城，洪水旗与锐金旗、巨木旗也都派了旗下弟子过来救人。五旗都在大都城中有秘密据点，一时间各行其是。
只是碧玉生与衣飞扬同时到达大都城，于是烈火旗、洪水旗与锐金旗弟子都听从衣飞扬号令，而巨木旗与厚土旗弟子则听从碧玉生号令。两方几乎是楚河汉界，互不打扰。
衣飞扬看到厚土旗送来的纸条当然是又喜又惊，于是拿进去与郭襄等人商量。郭襄看到还有其他重要人物，不解其意，但知道可能也是很重要的人物。纸条上写明郭破虏等人的关押之处，感觉要好好商议如何救人。
于是商量一番，得出结果，先由衣飞扬率领烈火旗协助巨木旗与厚土旗前往白塔寺伺机救人。郭襄苗道一等人在半路拦截去白塔寺救援的各路蒙古援军，主要是将军府中的高手。洪水旗与锐金旗弟子在旁边策应，伺机把蒙古其他援军引到别处。
若是白塔寺救人不出，再从攻入将军府救人，后面的事在随机应变，相机行事！
商量好后，衣飞扬与张康等人出去联络烈火、洪水、锐金三旗弟子。郭襄与苗道一等人率领全真弟子前往将军府外埋伏，郭襄正感觉人数太少，这时长春宫外又有人求见郭破虏。郭襄出去一看大喜，来人正是燕秋凝与乌拓邦，他们收到郭破虏令牌，便带领门下弟子赶来大都。
郭襄看到他们到来大喜，便告诉他们郭破虏被俘之事，燕秋凝与乌拓邦听了，自然要去救人。而且乌拓邦还找到“雷火堂”留下的暗器库，里面不仅有各种暗器，还有暗器发射器，于是此次来大都，便携带不少过来。燕秋凝说她也有蛇蝎等毒虫帮忙，郭襄听了更是大喜。
原来燕秋凝曾在毒王谷待过一段时间，早已学会了驱赶蛇蝎等毒虫，她又心仪明月楼，于是来大都前便去了一趟毒王谷，才发现明月楼不在谷中，谷中几位侍童也想寻找明月楼，燕秋凝告知明月楼也可能在大都，于是几位侍童便把蛇蝎等毒虫放在竹筐内，担着竹筐跟燕秋凝等人一起来到大都，只是他们没法进城，留在城外放养蛇蝎等毒虫。
燕秋凝让人去找毒王谷侍童，让他们带着蛇蝎等毒虫来帮忙。郭襄与燕秋凝等人便先来到将军府外埋伏。
先说衣飞扬带领烈火旗来到白塔寺，与厚土旗、巨木旗汇合。厚土旗早已在白塔寺周围砸地道，准备用火药炸开地宫入口，巨木旗则攻入白塔寺，以免白塔寺的番僧阻拦。可是厚土旗连炸几次，都无法炸开地宫入口。厚土旗一位香主看了看石头，摇头说：“这里石头太硬，火药威力不够，这里无法炸开救人。”
衣飞扬道：“塔楼中估计有入口，我们看能否进去？”于是三旗弟子便一起攻入白塔寺，遭到丹巴等番僧的阻拦。而且塔楼内番僧武功更强，根本无法攻入塔楼内。于是衣飞扬灵机一动，准备实行第二计划，于是让烈火旗在白塔寺内四处放火，并让厚土旗把炸药爆炸声音更大更响，准备引将军府分兵来救援。并告诉三旗弟子，看到有援军到来，立即撤退。
衣飞扬深怕舒不台不派人来，还捉住莫尼等十来个番僧，假治毒药让他们服下，告知他们若是不去通报白塔寺的情况，他们就会顷刻毒发身亡，并且痛苦不堪，生不如死。莫尼等番僧只得愿意听从，其实他们心想正好可以趁机向释迦摩萨报信，毕竟白塔寺真的岌岌可危。然后衣飞扬带他们去将军府外，十几人进入将军府准备通风报信，谁知却被将军府杀了数人。释迦摩萨听了莫尼的报信，又看到白塔寺火势越来越大，爆炸声也是巨大，担心白塔寺不保，忽必烈必然会问罪，也担心地宫入口被炸开，于是带领蒙古群雄匆匆赶往白塔寺救援。
衣飞扬早已告知郭襄等人，让他们抵抗一阵就放释迦摩萨过去，然后全力攻入将军府中救人。郭襄等人于是稍作拦截便放释迦摩萨离开。
等释迦摩萨一走，郭襄等人便开始攻入将军府内，却被铁甲兵与蒙古群雄围在将军府中，虽杀了大部分蒙古群雄，但是铁甲阵着实难对付，正当束手无策时，燕秋凝带领毒王谷侍童到来，燕秋凝把蛇蝎蜈蚣等毒虫放出，瞬间大破铁甲阵，并把房屋内埋伏的铁甲兵咬伤毒死大部分。
正当郭襄等人寻找帐篷时，哪知舒不台等人放火烧楼，浓烟把毒虫驱走，并招来几路元兵援军到来，一时郭襄等人又被围困起来。
就在这时，郭破虏与石元带着文天祥，孟清秋、吕薇，还有一个丑妇人到来，孟清秋与吕薇还各自抱着两个小孩。郭破虏与石元如大力巨神下凡，与郭襄等人里应外合，只打得蒙古大军死伤无数。舒不台在摩罗等人保护下逃走。
于是郭襄等人自知元兵援军很快到来，于是连忙向城外突围，在城门大杀一场后，逃出大都城，本以为逃出生天，谁知却又中了萨满教的埋伏。原来萨满教诸大长老听到郭破虏在将军府被捉，深怕郭破虏会投降大元忽必烈，于是准备抢人。不过他们看到郭襄等人也要救人，所以就暗中隐藏起来，想等郭襄等人与将军府两败俱伤时，在渔翁得利，抢走郭破虏。
于是看到郭襄等人出城，便在此处埋伏等待，郭襄等人过来，于是两派又混战一场，互有伤亡。郭破虏与石元由于内力恢复不久，又消耗太大，经此一役，已经支持不住，便做下疗伤。
这时舒不台又率领一支铁甲军追来，把两方人围在中间。郭襄与长生子对这一点铁甲兵当然都没放在眼里，可是知道若不立刻走，后面的元兵援军若是到来，两方谁也走不了。于是郭襄与长生子商定，两方各出一人相斗一场，谁若胜了，便可以带走郭破虏。