待小刚等人离开后，小智在光之灵引导下来到了密阿雷市附近的一片森林中，只见一只双眼通红的黑暗洛奇亚趴在森林的中心。
“黑暗洛奇亚？！”当小智见到黑暗洛奇亚的那一瞬间，立马戒备了起来。
“光明使者你不用担心，我不会攻击你的！”黑暗洛奇亚说道。
“你居然没有失去理智？不对！按道理来讲...在狗豪死的那一刻，所有被黑暗之力侵蚀的宝可梦都应该恢复原状才对，你为什么还没有恢复？”小智发现了盲点。
“我也不知道这是怎么回事？在狗豪身死的那一瞬间，我虽然恢复了理智，但似乎无法变回原来的模样了。”黑暗洛奇亚摇了摇头回答道，但它心中也非常困惑。
“黑暗洛奇亚之所以无法恢复原来的模样，是因为它体内有一枚类似黑色结晶的物质。”光之灵回答道。
“类似黑色结晶的物质？我体内为什么会有这种东西？”黑暗洛奇亚疑惑道。
“应该是某种变故导致入侵你体内的黑暗之力凝结成这块结晶，至于具体情况我也不太清楚。”光之灵回答道。
“那你是否有办法消除这块黑色结晶？”黑暗洛奇亚询问道。
“可以尝试一下，但是否能成功我不敢确定。我现在将你拖进本源空间，你不要抗拒！”光之灵说道。
“嗯~”黑暗洛奇亚点点头。
得到黑暗洛奇亚首肯后，从光明之石中射出一道光芒将黑暗洛奇亚笼罩在其中，随即在光之灵的操控下，黑暗洛奇亚的体型逐渐变小，紧接着化作一道光芒进入光明之石之中和达克莱伊作伴...
“累死我了...看来我又得进入沉睡了。”
“不过在沉睡之前，我有件事情需要跟你说清楚:虽然你平时使用光明之力以及羁绊进化是借助光明之石，但你体内的确激活了光明之力。”光之灵郑重的说道。
“你的意思是...就算我没有了光明之石，也是可以使用光明之力和羁绊进化？”小智惊讶的问道。
“没错~光明之石的作用其实就是激活你体内的那股力量，而不是失去了光明之石，你就无法使用光明之力。”光之灵回答道。
“体内的那股力量是光明之力吗？”小智疑惑的问道。