在椪柑岛和小智等人相遇，给正美的哥哥阿功展示过水晶大岩蛇后，小夜和鸣依再次踏上了蜜月旅行。
期间还和小智在冰天王科拿的故乡，分别和科拿进行了一次交流对战。再次遇到小智时，已经是橘子群岛的联盟大会决赛了。
小夜和鸣依坐在观众席上，观看着小智和橘子群岛的首席训练家勇次的对战。
小智真的成长了很多，皮卡丘拿下了百变怪，水箭龟非常容易的打败了大岩蛇，喷火龙拿下了妙蛙花。最终，小智竟然以三比零的优势进入了中场休息的阶段。
趁着中场休息的半个小时，小智跑去和小夜聊了几句。
这一年多的经历，让这个傻东西多少明白了小夜的苦心。
（小夜：看，之前一起旅行的时候我天天零封他，到现在他还得感谢咱呢。）
小智在橘子群岛联盟大会的最后决战很快就开始了，以妙蛙花打掉对方的电击兽，拉普拉斯和耿鬼互换后。
最后的决战来了！
身为橘子群岛的首席训练家，勇次最强大的宝可梦是一只快龙。
自从快龙上场之后，局势就有了些许逆转。快龙一路打败了小智的关东地区御三家，最后才和同样丝血的皮卡丘互换掉了。就此，小智以五只宝可梦赢下了勇次的全队，拿到了人生之中第一个最高级的荣誉。
胜利者杯，小智高举着那纯金的奖杯，和勇次一同合照。此刻，小智正式成为了橘子群岛的荣誉训练家。
橘子群岛某处海域最深处，一个漩涡慢慢的生成，一双猩红的眸子亮了起来。
海域的亚空间中，银发的少年盘膝坐在那凶兽头顶，两者的眼眸同样一片猩红。
“祂的使者啊，不要让我失望，不要辜负了尔等‘堕天神’之名号。”黄泉恶意的笑着，随意的丢出数枚漆黑的宝石，顿时那旋涡中隐藏的恶神更加拼命的挣扎了起来，封印祂的结界逐渐出现了裂纹。（p－357－堕天神yyds，好扣爱扣。开局一把狙，决算p，俺是扣哥！）
深海，一只银色的大鸟探出了海面。
祂忧心忡忡的注视着‘海之魔’所在的位置，神眸里满是担忧。
‘命运的齿轮开始转动了吗……海之魔露基亚，堕天之神……’洛奇亚痛苦的闭上了眼眸，‘至少，也要护住这漩涡列岛上生活的芸芸众生，以‘海之神’的名义……’